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"TMario Costa Cruzrata-se de oportunidade única para expandir o conhecimento dos alunos em análise de imagem e extrair mais informações de dados já obtidos pelos mesmos"

Entre os dias 9 e 11 de outubro, o programa de pós-graduação em Biologia Celular do Instituto de Ciências Biológicas da UFMG vai oferecer uma disciplina teórica e prática (MOF 080), aberta ao público externo, dirigida a pesquisadores interessados em analisar imagens biomédicas de seus projetos usando o software CellProfiller. Além de ter experiência prévia com microscopia e bioimagem, é preciso ter um conjunto de dados para serem analisados durante o curso.

Serão disponibilizadas apenas dez vagas, gratuitas.

A inscrição e a seleção dos inscritos será feita a partir de carta motivacional, com no máximo 600 caracteres, na qual o interessado deve apresentar, de forma clara e direta, porque ele deveria ser selecionado para essa disciplina. A carta deve ser encaminhada para e .

Segundo a professora Cristina Guatimosim, do departamento de Morfologia do ICB, uma das responsáveis pela disciplina, esta será "uma oportunidade única para expandir o conhecimento dos alunos em análise de imagem e extrair mais informações de dados já obtidos pelos mesmos, através do uso do CellProfiller", afirma. Ela esclarece ainda que o software foi desenvolvido por pesquisadores do Broad Institute vinculado ao Massachussetts Institute of Technology (MIT).

O encontro é promovido pela BioImaging Network of Minas Gerais (BioIMG Net), uma rede científica apoiada pela Chan Zuckerberg Initiative ao redor do mundo, com o objetivo de promover o avanço das pesquisas com imagens biomédicas.

INSTRUTOR

Graduado em Biomedicina, Mário Costa-Cruz (ICB-USP linkedin.com/in/mario-costa-cruz-87ba77b3) é doutor em Ciências, no campo da Biologia Celular, e mestre em Microbiologia e Imunologia. Responsável pelo núcleo CONFOCAL do Core Facility for Support Research, Centro de Facilidades para Apoio a Pesquisa (Cefap-USP). Ele também trabalhou no laboratório de Beth Cimini, pesquisadora que participou do desenvolvimento do software, no MIT, e atualmente é responsável pela sua manutenção para uso público.

CRONOGRAMA RESUMIDO

Disciplina "Análise de imagem utilizando CellProfiler"
Créditos: 1 Carga horária: 15 horas-aula; Professores responsáveis: Cristina Guatimosim e Greg Kitten

Segunda-feira - 9/10/2023
9h - 11h Apresentação e Introdução à Análise de Imagens
13h - 14h Conceitos básicos e Introdução ao CellProfiler
14h - 16h Análise de imagens 2D CellProfiler (Hands-on)
16h30 - 17h30 Aberto para discussão de projetos

Terça-feira - 10/10/2023
9h - 11h Análise de imagens 3D CellProfiler (Hands-on)
13h - 15h Machine learning e Deep Learning para segmentação e classificação de objetos
15h30 - 17h Análise de imagens no browser (Piximi.app)

Quarta-feira - 11/10/2023
9h - 16h Discussão de projetos (traga suas imagens e perguntas)

MAIS INFORMAÇÕES: https://www.youtube.com/@bioimgnet ou

 

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