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(from left to right: Pedro, Rafa, Gustavo, Bráulio, Erick (missing Ana)


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We have recently contributed with Chapter 2 of the book "Satellite DNAs in physiology and evolution", published by Springer in August 2021.

Kuhn GCS, Heringer P, Dias GB. Structure, Organization, and Evolution of Satellite DNAs: Insights from the Drosophila repleta and D. virilis Species Groups. Prog Mol Subcell Biol. 2021;60:27-56. doi: 10.1007/978-3-030-74889-0_2.


Repetitive DNAs make up more than 50% of the genome of most organisms. They are classified into two major classes according to their genomic organization. The first class is composed of DNA motifs of various lengths and composition that occur as tandem repeats that are localized at one or more distinct positions in the genome. The second class is represented by sequences with a dispersed distribution throughout the genome. The majority of these “tandem” or “dispersed” repeats are represented by highly repetitive DNA (>10.000 copies) elements that do not code proteins used by the cell, such as satellite DNAs and transposable elements, respectively. Changes in their primary structure, copy number and chromosomal distribution occur frequently and rapidly during evolution, promoting drastic genome changes even among closely related species. Given the participation of these elements in gene regulation, chromatin modulation and chromosome rearrangements, these changes are also expected to impact the evolution of populations and species.

The aim of our group is the study of several proprieties of these repetitive DNAs, including:



  • Structure

  • Origin

  • Organization

  • Function

  • Variation

  • Evolutionary relationships with other genetic elements

  • Mechanisms of molecular evolution and turnover

  • Maintenance in the genome

  • Impact in the architecture of chromosomes and genomes

  • Impact in the evolutionary process




Linhas gerais dos nossos projetos:

DNAs repetitivos representam mais do que 50% do genoma de muitos organismos. Alterações na abundância e distribuição cromossômica destes elementos ocorrem rapidamente e freqüentemente ao longo da evolução de espécies, causando mudanças drásticas no genoma. Nossos projetos têm como objetivo estudar vários aspectos destes elementos, tais como: origem, estrutura, organização, variação, relação com outros elementos genéticos, distribuição cromossômica, mecanismos de manutenção e impactos no processo evolutivo.

Projetos atuais incluem estudos em grande escala de DNAs repetitivos (principalmente DNAs satélites e transposons) em espécies de Drosophila de genoma seqüenciado.

Nossos estudos pretendem contribuir para um melhor entendimento de vários aspectos sobre os DNAs repetitivos, como sua origem, estrutura, mecanismo de amplificação, evolução e função.

Técnicas envolvidas: ferramentas de bioinformática, técnicas de biologia e citogenética molecular. Os projetos contam com colaborações internacionais na Inglaterra, EUA e Espanha.

Acesse o link abaixo para visualizar um pequeno vídeo sobre nossa área de pesquisa:

https://www.youtube.com/watch?v=uWLc2_rGMo4&t=7s



Collaborations:

Prof. Dr. Harmit Malik (Fred Hutchinson Cancer Research Institute, Seattle, USA)

Prof.Dr. Marta Svartman (Universidade Federal de Minas Geras, Brasil)

Prof. Dr. Pat Heslop Harrison and Prof.Dr.Trude Schwarzacher (University of Leicester, UK)

Prof. Dr. Alfredo Ruiz (Universidad Autónoma de Barcelona, Spain)