Habilidades em bioinformática

Alguns comandos Linux que podem ser usados com cygwin:

cp teste.seq manuel [copia o arquivo teste.seq para o diretório manuel, dentro do mesmo diretório
cp teste.seq ../manuel [o diretório manuel está num nível acima do diretório de trabalho
mv teste.seq manuel/seqs [move o arquivo teste.seq para o diretório seqs
mkdir seqs [cria o diretório seqs]
rmdir seqs [remove o diretório seqs e seu conteúdo]
rm teste.seq [remove o arquivo teste.seq]
cd .. [sobe um diretório]
cd manuel [entra no diretório manuel]
ls [lista conteúdo do diretório]
ls -l [lista com mais informações]
man ls [mostra o manual para o programa ls] - use info ls no cygwin
q [interrompe o output do manual e do comando more do Linux]
more [no Linux imprime na tela o conteúdo do arquivo]
head [imprime as primeiras linhas do arquivo]
tail [imprime as últimas linhas do arquivo]
tabulador e asterisco: são usados para nomes compridos. O tabulador completa o nome, o asterisco abre o arquivo indicado, por exemplo:
more *bls imprime na tela [readme.bls], assim como more *bl*.